Som trondd sier programmer for elektronikk er faktisk veldig bra på Linux. Og som du selv sier alle de store tunge profesionelle verktøyslevrandørene har Linux versjoner(Ikke Cadstar desverre). For eksempel Mentor og Synopsis, men det blir jo i en ganske brutal prisklasse:-)
Skal du programeree microkontrollere bør du også ta en titt på SDCC, som har støtte for 8085 varianter, PIC og lingnende.
Og for FPGA/CPLD kretser bør du sjekke ut Xilinx sitt tilbud, jeg tror de er mye greiere med student/gratis versjoner en Altera.(Du må antagelig maile/fylle ut et webform først).
Er du interesert i simulering kommer jo de fleste distribusjoner med Spice, uten sånne teite node begrensninger som tilsvarende programer på den andre platformen ofte har. Og du slipper de klønete og tungvinte grafiske brukergrensesnittet du som regel må slite med der. Det går både raskere og er mer fleksibelt å skrive nettlister for hånd(Skisere kretsen gjør du raskere på papir).
For en del oppgaver for VK1/VK2, som enkel simulering og eventuelt litt PIC programering, virker KTechlab som en enkel og oversiktlig løsning.
http://www.kde-apps.org/content/show.php?content=18943